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Aumentar el catálogo de canto de aves y afinar el software sería más rápido que su diseño y prueba, dijo Arturo Castro.
FOTO ALFREDO HUERTA / PARA EF

Bioinformática | Proyecto de graduación de estudiante de maestría en informática de UCR

Crean software para reconocer canto de aves


Carlos Cordero Pérez

Puede usarse en educación y turismo

Arturo Castro es biólogo, saxofonista y está elaborando la tesis para el posgrado en informática de la Universidad de Costa Rica (UCR), tarea en la que precisamente mezcla esas tres facetas para diseñar un software que reconoce el canto de las aves.

Por ahora, el sistema incluye 126 cantos de cinco especies de aves y la idea es que en poco tiempo finalice su desarrollo contemplando al menos 100 especies.

Sin embargo, el programa cuenta con capacidad para reunir la información del canto de los 800 grupos de pájaros que hay en Costa Rica y para utilizarlo en otros países con sus propias especies o con otros animales nativos.

“En este momento tenemos un 50% de desarrollo”, afirmó Castro.

Él actualmente labora como encargado del proyecto de bioinformática de la Organización para Estudios Tropicales (OET), entidad formada por varias universidades –incluida la misma UCR–, donde este sistema podría utilizarse en proyectos de investigación biológica.

En este caso, el sistema ayudaría a identificar la cantidad, comportamiento y ubicación de individuos de una especie a partir de su canto para estudios de los especialistas en biología, conservación y protección ambiental, pero también se podría aprovechar en educación y en tours turísticos.

El sistema permite usarlo en dispositivos móviles como equipos con sistema de posicionamiento geográfico (GPS, por sus siglas en inglés), computadoras manuales (handheld) o agendas portátiles digitales (PDA).

Según Gabriela Marín, directora del programa de posgrado de la UCR, la capacidad de Castro en biología, música e informática ayudó a crear un producto en el que se requieren habilidades multidisciplinarias que son difíciles de conseguir. “Él puede explotar sus propios conocimientos”, dijo Marín.

Como un cerebro

El sistema se diseñó basándose en el concepto de “redes neuronales artificiales” que establece que las personas identifican objetos, personas, sonidos y movimientos a partir de patrones o modelos conocidos (véase recuadro: “Oído virtual”).

Este tipo de sistemas también se utiliza en los servicios de identificación y control de pautas publicitarias, por ejemplo.

La identificación de la forma de comunicación entre animales se emplea en la investigación de ballenas y de diferentes mamíferos, reptiles, anfibios y hasta insectos.

Sin embargo, en el caso del desarrollado por Castro habrá que habilitarlo para que pueda identificar el sonido del ave y lo diferencie de otros ruidos del ambiente.

Además, se debe realizar una ardua labor para grabar, codificar y probar el canto de las aves locales, todo lo cual ha implicado hasta ahora una inversión personal de más de US$40.000, contabilizando las horas dedicadas al trabajo de campo y al desarrollo del software.

Castro dijo que además de incluir el canto de un mayor número de aves, falta afinar el programa para incorporarlo en dispositivos móviles y que se realicen reconocimientos directos en los mismos sitios, lo que podría llevarle un año más.

Perspectiva empresarial

Según el mismo Arturo Castro, buena parte de la labor comercial será una tarea que deberá realizar alguna empresa.

“Él es más académico y para comercializar este tipo de proyectos se requiere muchos recursos económicos”, dijo Marín, de la UCR.

Probablemente las compañías interesadas también encontrarán a la par otros sistemas bioinformáticos que podrían desarrollar comercialmente.

Según Erick Mata, especialista en este campo y actual coordinador de informática del Instituto Nacional de Biodiversidad (INBio), a la mayoría de proyectos de bioinformática en el país les ha sido imposible saltar la brecha entre la producción académica y la comercialización.

“A nivel académico es muy fuerte la actividad de desarrollo de productos por la convergencia de la biología y la informática”, dijo Mata que impulsa la cátedra Unesco de bioinformática en el Instituto Tecnológico de Costa Rica y un congreso que se llevará a cabo en el segundo semestre del 2007 sobre el mismo tema.

Además, recientemente impulsó el establecimiento de un convenio del INBio con la incubadora de empresas ParqueTec para convertir los proyectos de bioinformática en productos viables científica y comercialmente. Según Mata, se iniciará con tres proyectos.

Oído virtual

Claves del sistema para identificar el canto de aves:

Rastreador: Se basa en rama de la biología conocida como bioacústica, que estudia las especies a partir de la comunicación entre sus individuos.

Cerebro digital: Basado en “redes neuronales artificiales”, que establece que se reconocen sonidos a partir de patrones conocidos pese a variaciones que se dan en el canto de un mismo individuo y discrimina otros ruidos (ríos, viento, otros animales).

Entrenamiento del sistema: Se incluyen en el software fracciones de los sonidos, codificadas (datos básicos) y cada archivo se pasa hasta 100.000 veces para garantizar un reconocimiento superior al 90%. Cada nuevo canto debe ser incluido en el programa para ser reconocido posteriormente.

Identificación: La matriz sistema es muy liviana (menos de 1 MB) y permite identificación en el campo con dispositivos móviles.

Fuente: Arturo Castro.


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